培養基按營養物質的來源可分為：

       （1）天然培養基：由化學成分不完全明了的天然物質組成；

       （2）合成培養基：全部由已知化學成分的物質組成；

       （3）半合成培養基：由不明化學成分的天然物質和已知化學成分的物質組成。

       培養基按物理性狀可分為：

       （1）液體培養基：不含凝固劑，利于菌體的快速繁殖、代謝和積累產物；

       （2）流體培養基：含0.05%～0.07%瓊脂粉，可降低空氣中氧進入培養基的速度，利于一般厭氧菌的生長繁殖；

       （3）半固體：含0.2%～0.8%瓊脂粉，多用于細菌的動力觀察、菌種傳代保存及貯運細菌標本材料；

       （4）固體培養基：含1.5%～2%瓊脂，用于細菌的分離、鑒定、菌種保存及細菌疫苗制備等多方面。

       培養基按功能可分為：

       （1）運輸培養基：在取樣后和實驗室樣品處理前的時間保護和維持微生物活性的培養基。運輸培養基中通常不允許包含使微生物的增殖的物質，但是培養基應能保護菌種，確保他們不質變(如：Stuart運輸培養基或Amies運輸培養基)。

       （2）保存培養基：用于在一定期限內保護和維持微生物活力，以防對微生物在長期保存中產生不利影響，或使微生物在長期保存后容易復蘇（如：Dorset卵黃培養基）的培養基。

       （3）復蘇培養基：能夠使受損或應激的微生物修復、使微生物恢復正常生長能力，但不一定促進微生物繁殖的培養基。

       （4）增菌培養基：大多為液體培養基，能夠給微生物的繁殖提供較適當的生長環境。

①選擇性增菌培養基：能夠保證特定的微生物在其中繁殖，而部分或全部抑制其它菌體生長的培養基（如：Rappaport-Vassiliads培養基）；

②非選擇性增菌培養基：能夠保證大多數微生物生長（如：營養肉湯）的培養基。

       （5）分離培養基：

①選擇性分離培養基：支持特定微生物的生長而抑制其他微生物生長的培養基（如：DHL瓊脂，EMB瓊脂，MarConkey瓊脂），常用的抑菌劑有膽鹽、煌綠、玫瑰紅鈉、亞硒酸鈉，常用的指示劑有溴甲酚紫、溴麝香草酚藍等，美藍是氧化還原指示劑；

②非選擇性分離培養基：對微生物沒有選擇性抑制的分離培養基（如：營養瓊脂）。

       （6）鑒別培養基：能夠進行一項或多項微生物生理學和生化特性鑒定試驗的培養基，（如：尿素培養基，Kligler瓊脂）；能夠用于分離培養的鑒別培養基被稱作為分離/鑒別培養基（例如XLD瓊脂）。

       （7）鑒定培養基：能夠產生一個特定的鑒定反應而不需要做進一步確認實驗的培養基。用于分離的鑒定培養基被稱為分離/鑒定培養基。

       （8）多種用途的培養基：同時具有多種不同用途的特定培養基。例如，血瓊脂是一種復蘇培養基；同時又是分離培養基；用于溶血檢測時為鑒別培養基。